Les variétés de sorgho (Sorghum bicolor subsp. bicolor) sont traditionnellement classées en cinq races principales sur la base de caractères morphologiques, en particulier des caractères de panicule et de grains. Les isozymes ont apporté une nouvelle vision de la diversité et révélé une structuration essentiellement géographique. Sur la base d'une analyse RFLP portant sur 35 sondes et 158 bandes polymorphes, la race bicolor est apparue hautement variable avec de nombreux allèles rares. Parmi les autres races, une analyse multivariée a révélé six groupes auxquels correspondent, par ordre de différenciation décroissante, les formes margaritiferum (un sous ensemble de la race guinea); les types guinea d'Afrique de l'Ouest ; la race caudatum ; la race durra ; la race kafir ; les types guinea d'Afrique australe. La part respective de la race et de l'origine géographique est incertaine.

Une vaste étude de diversité morphoagronomique et moléculaire a été conduite avec l’Icrisat et a permis de construire différentes core collections en suivant différentes méthodes et d’en comparer la diversité. Aucune différence marquante n’a été observée, mais l’exercice a permis d’identifier des collections représentatives utiles pour y concentrer des travaux d’évaluation agronomique et des efforts d’utilisation dans les programmes d’hybridation (Grenier et al.., 2000a, 2000b, 2001a, 2001b).

Une carte génétique a été produite avec des cDNA de sorgho (collaboration avec Rustica) et des sondes hétérologues déjà cartographiées chez le riz, ainsi que 137 locus AFLP, portant la longueur à 1899 cM, proche de la saturation (Boivin et al.., 1999).

Cette carte a été utilisée pour localiser des QTL de caractéristiques du grain (Rami et al.., 1998). La carte a été comparée à celle du riz sur la base de 123 locus communs. Des inversions et translocations locales ont ainsi pu être révélées (Ventelon et al.., 2001).

Le contrôle génétique de la durée du cycle a été analysé au sein de la population RIL249. Un QTL de réponse à la photopériode a été identifié pour la PVB, et 2 QTL pour la réponse à la photopériode (Chantereau et al.., 2001).

Une nouvelle population inter-raciale de 194 lignées recombinantes (en F6) issues de Sariaso 10 (caudatum) et 249 (parent de la population RIL249) est étudiée à l’Inera (Burkina Faso) pour une cartographie de QTL pour le contenu en sucre et en fibres des tiges, le caractère " staygreen " ainsi que divers autres caractères agronomiques.

Une centaine de nouveaux marqueurs microsatellites ont été développés dans le cadre d’un projet Génoplante, en collaboration avec le CNS, ainsi qu’une banque BAC du parent Sariaso 10.

Une nouvelle approche est explorée, basée sur le déséquilibre de liaison (DL) parmi les variétés cultivées et visant à effectuer des études d’associations telles qu’elles sont développées chez l’homme. Une collection de 200 accessions représentative de la diversité de l'espèce a été caractérisée au moyen de 75 sondes RFLP polymorphes bien réparties sur l'ensemble du génome dans le cadre d'un projet BRG, puis au niveau de douze locus très liés sur le chromosome D. L’analyse des données, en cours, révèle des associations fortes entre blocus séparés par plus de 1 cM et 250 kb.

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